深海动物


深海动物
6个

甲硼烷正戊基磺酰胺与CA II的复合物


实验数据快照

  • 方法: X射线衍射
  • 解析度: 1.00 ?
  • 无R值: 0.140 
  • R值工作: 0.126 
  • 观察到的R值: 0.126 


文学

磺酰胺基双氨基甲酸酯对癌症相关的碳酸酐酶IX的选择性的结构基础。

M·库格勒Holub,J。布林达,J。波斯皮洛娃(K.南安华巴沃尔哈夫拉内克(M.克拉尔(V.Fabry,M.格纳B.里扎科娃

(2020)J酶抑制素医学 35: 1800-1810

  • DOI: 10.1080/14756366.2020.1816996
  • 相关结构的主要引文: 
    6Z04, 6年制, 6YZO, 6岁, 6YZQ, 6YZT, 6YZS, 6YZV, 6个, 6YZJ

  • PubMed摘要: 
  • 人碳酸酐酶IX(CA IX)是一种在实体瘤细胞表面上特异性表达的蛋白质,是抗癌治疗和诊断的有效靶标。我们最近确定了磺胺二甲碳硼烷是有希望的具有良好活性的CA IX抑制剂。体外体内 ...

    人碳酸酐酶IX(CA IX)是一种在实体瘤细胞表面上特异性表达的蛋白质,是抗癌治疗和诊断的有效靶标。我们最近确定了磺胺二甲碳硼烷是有希望的具有良好活性的CA IX抑制剂。体外体内。为了解释它们的选择性和效力,我们对CA IX和CA II的活性位点之间的相互作用进行了详细的X射线结构分析。考察了在双碳硼烷簇和磺酰胺基团之间带有各种脂族连接基的一系列化合物。观察到与活性位点腔的疏水部分的优先结合。对CA IX的选择性在于双碳硼烷簇与具有V131残基的特定CA IX疏水性斑块的形状互补性。 CA II中F131残基的庞大侧链会改变催化腔的形状,从而破坏球形双碳六硼烷簇的良好相互作用。


    组织隶属关系

    捷克科学院,捷克科学院分子遗传研究所,结构生物学系。



大分子
通过以下方式查找相似的蛋白质:  (通过身份截止)  | 结构体
实体编号:1
分子链条序列长度生物细节图片
碳酸酐酶2A260智人变异: 0 
基因名称: CA2
EC: 4.2.1.1
查找蛋白质 P00918 (智人)
探索 P00918 
转到UniProtKB: P00918
NIH共同基金数据资源
法罗斯 P00918
深海动物
蛋白质特征视图
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  • 参考序列
小分子
配体 3独特
ID链条名称/公式/ InChI键2D图3D互动
Q38
查询Q38

下载CCD文件 
A
碳硼烷正戊基磺酰胺
C7 H12 B9 一氧化氮2 S
GTLHEFZDKOVWKR-UHFFFAOYSA-N
 配体相互作用
Q4B
在Q4B上查询

下载CCD文件 
A
碳硼烷正戊基磺酰胺
C7 H12 B9 一氧化氮2 S
GTLHEFZDKOVWKR-UHFFFAOYSA-N
 配体相互作用
ZN
在ZN上查询

下载CCD文件 
A
锌离子

PTFCDOFLOPIGGS-UHFFFAOYSA-N
 配体相互作用
实验数据& 验证方式

实验数据

  • 方法: X射线衍射
  • 解析度: 1.00 ?
  • 无R值: 0.140 
  • R值工作: 0.126 
  • 观察到的R值: 0.126 
  • 空间组: 1 21 1
晶胞:
Length ( ? )Angle ( ? )
a = 42.258α = 90
b = 41.385β = 104.31
c = 71.838γ = 90
软件包:
软件名称目的
XDS数据缩减深海动物
XSCALE数据缩放
REFMAC细化
PDB_EXTRACT数据提取
快速傅立叶变换分阶段

结构验证

视图 完整验证报告



进入历史 & 资金信息

沉积数据


资助机构位置授权号
捷克科学基金会捷克共和国GA15-05677S
其他政府捷克共和国TE01020028

修订记录 

  • 版本1.0:2020-10-28
    类型:初始版本
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